Detalhe da pesquisa
1.
Machine learning-driven multiscale modeling reveals lipid-dependent dynamics of RAS signaling proteins.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 119(1)2022 01 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34983849
2.
Uncovering a membrane-distal conformation of KRAS available to recruit RAF to the plasma membrane.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 117(39): 24258-24268, 2020 09 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32913056
3.
Development of Martini 2.2 parameters for N-glycans: a case study of the HIV-1 Env glycoprotein dynamics.
Glycobiology
; 31(7): 787-799, 2021 08 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33755116
4.
Unveiling the Dynamics of KRAS4b on Lipid Model Membranes.
J Membr Biol
; 254(2): 201-216, 2021 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33825026
5.
Anionic Lipids Impact RAS-Binding Site Accessibility and Membrane Binding Affinity of CRAF RBD-CRD.
Biophys J
; 119(3): 525-538, 2020 08 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32649863
6.
Machine Learning Algorithm Identifies an Antibiotic Vocabulary for Permeating Gram-Negative Bacteria.
J Chem Inf Model
; 60(6): 2838-2847, 2020 06 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32453589
7.
Graph-Directed Approach for Downselecting Toxins for Experimental Structure Determination.
Mar Drugs
; 18(5)2020 May 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32422972
8.
Membrane perturbing properties of toxin mycolactone from Mycobacterium ulcerans.
PLoS Comput Biol
; 14(2): e1005972, 2018 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29401455
9.
Co-evolution of a broadly neutralizing HIV-1 antibody and founder virus.
Nature
; 496(7446): 469-76, 2013 Apr 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23552890
10.
Computing long time scale biomolecular dynamics using quasi-stationary distribution kinetic Monte Carlo (QSD-KMC).
J Chem Phys
; 151(7): 074109, 2019 Aug 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31438708
11.
Snails In Silico: A Review of Computational Studies on the Conopeptides.
Mar Drugs
; 17(3)2019 Mar 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30832207
12.
Effect of Glycosylation on an Immunodominant Region in the V1V2 Variable Domain of the HIV-1 Envelope gp120 Protein.
PLoS Comput Biol
; 12(10): e1005094, 2016 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27716795
13.
Increased enzyme binding to substrate is not necessary for more efficient cellulose hydrolysis.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 110(27): 10922-7, 2013 Jul 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23784776
14.
Membrane-mediated regulation of the intrinsically disordered CD3ϵ cytoplasmic tail of the TCR.
Biophys J
; 108(10): 2481-2491, 2015 May 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25992726
15.
A data-driven approach to modeling the tripartite structure of multidrug resistance efflux pumps.
Proteins
; 83(1): 46-65, 2015 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24957790
16.
Viral escape from neutralizing antibodies in early subtype A HIV-1 infection drives an increase in autologous neutralization breadth.
PLoS Pathog
; 9(2): e1003173, 2013 Feb.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23468623
17.
A mechanistic understanding of allosteric immune escape pathways in the HIV-1 envelope glycoprotein.
PLoS Comput Biol
; 9(5): e1003046, 2013.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23696718
18.
Predicting permeation of compounds across the outer membrane of P. aeruginosa using molecular descriptors.
Commun Chem
; 7(1): 84, 2024 Apr 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38609430
19.
Taste of sugar at the membrane: thermodynamics and kinetics of the interaction of a disaccharide with lipid bilayers.
Biophys J
; 104(3): 622-32, 2013 Feb 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23442913
20.
Recurrent signature patterns in HIV-1 B clade envelope glycoproteins associated with either early or chronic infections.
PLoS Pathog
; 7(9): e1002209, 2011 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21980282